Organami spółki PKS Polonus w Warszawie S.A. są:

• Walne Zgromadzenie Akcjonariuszy
• Rada Nadzorcza

Przewodniczący Rady Nadzorczej – Adam Edmund Fronczak
Wiceprzewodniczący Rady Nadzorczej – Paweł Stanisław Zięba
Członek Rady Nadzorczej – Agata Wicik
Sekretarz Rady Nadzorczej – Przedstawiciel Pracowników – Piotr Zych
Członek Rady Nadzorczej – Przedstawiciel Pracowników – Kamil Kowalski

Zarząd Spółki:

Prezes Zarządu – Piotr Smogorzewski

Członek Zarządu – Piotr Grzegorczyk