Organami spółki PKS Polonus w Warszawie S.A. są:

• Walne Zgromadzenie Akcjonariuszy
• Rada Nadzorcza

Przewodniczący Rady Nadzorczej – Adam Edmund Fronczak
Członek Rady Nadzorczej – Agata Wicik
Członek Rady Nadzorczej – Paweł Stanisław Zięba
Sekretarz Rady Nadzorczej – Przedstawiciel Pracowników – Piotr Zych
Członek Rady Nadzorczej – Przedstawiciel Pracowników – Kamil Kowalski

Zarząd Spółki:

p.o. Prezesa Zarządu – Paweł Stanisław Zięba

Funkcję Prokurenta spółki pełnią:

Małgorzata Ostrowska
Edyta Sobolewska-Socha